Полонский уезжает: в Смоленской областной прокуратуре меняется руководитель
экономической академии. Службу в органах прокуратуры начал в июле 2000 года с должности следователя прокуратуры в Ростове-на-Дону.
С годами Сергей Карапетян поднимался вверх по карьерной лестнице. Был старшим помощником прокурора, затем заместителем прокурора, после руководителем следственного отдела при прокуратуре.
С декабря 2012 года состоял в должности прокурора Октябрьского района Ростова-на-Дону Ростовской области.
На последней должности (зам прокурора Красноярского края) - с января 2018 года. Там он курировал вопросы управления правовой статистики, отдела по надзору за процессуальной деятельностью органов Следственного комитета Российской Федерации, организации работы по экстрадиции, вопросы рассмотрения обращений и приема граждан, правового обеспечения, связей с общественностью, вопросы пенсионного обеспечения.